Механизм связывания метиленового синего с одноцепочечными синтетическими полинуклеотидами poly(rA) и poly(rU)
Аннотация
Изучено связывание тиазинового красителя метиленового синего (МС) с одноцепочечными (оц-) синтетическими полирибонуклеотидами полирибоадениловой (poly(rA)) и полиуридиловой (poly(rU)) кислот методами абсорбционной спектроскопии и УФ-плавления. Обнаружено, что механизмы связывания МС с poly(rA) и с poly(rU) существенно различаются. Полученные данные указывают на то, что основной способ взаимодействия МС с оц-poly(rA) соответствует полуинтеркаляции, с оц-poly(rU) — электростатическому связыванию. Выявлено, что МС способствует образованию гибридного дуплекса poly(rA)-poly(rU).
Ключевые слова
Об авторах
З. О. МовсесянАрмения
Ереван
А. П. Антонян
Армения
Ереван
П. О. Вардеванян
Армения
Ереван
Список литературы
1. A. B. Pradhan, L. Haque, S. R. S. Das. PLoS One, 9, N 2 (2014) e8799
2. S. Miljanic, A. Kenđel, M. Novak, T. G. Deliqeorqiev, I. Crnolatac, I. Piantanidac, V. Chis. RSC Adv., 6 (2016) 41927—41936
3. M. Maiti, G. S. Kumar. Med. Res. Rev., 27 (2007) 649—695
4. H. Ihmels, D. Otto. Topics in Current Chemistry: Supramolecular Dye Chemistry, Berlin, Springer (2005)
5. R. Palchaudhuri, P. J. Hergenrother. Curr. Opin. Biotechnol., 18 (2007) 497—503
6. N. Foloppe, N. Matassova, F. Aboul-ela. Drug Disc. Today, 11 (2006) 1019—1027
7. Z. Liu, A. Sall, D. Yang. Int. J. Mol. Sci., 9 (2008) 978—999
8. S. Fulle, H. Gohlke. J. Mol. Recognit, 23 (2010) 220—231
9. P. Giri, G. S. Kumar. Biochim. Biophys. Acta, 1770 (2007) 1419—1426
10. O. P. Cetinkol, N. V. Hud. Nucl. Acids Res., 37 (2009) 611—621
11. P. Giri, G. S. Kumar. Arch. Biochem. Biophys., 474 (2008) 183—192 [12] H. Xi, D. Gray, S. Kumar, D. P. Arya. FEBS Lett., 583 (2009) 2269—2275
12. А. П. Антонян, Н. Р. Петросян, П. О. Вардеванян. Журн. прикл. спектр., 88, № 6 (2021) 942—947
13. M.-E. Nedu, M. Tertis, C. Cristea, A. V. Georgescu. Diagnostics, 10 (2020) 223
14. N. D. M. Sani, E. Y. Ariffin, W. Sheryn, M. A. Shamsuddin, L. Y. Heng, J. Latip, S. A. Hasbullah, N. I. Hassan. Sensors, 19 (2019) 5111
15. S. Tchen, J. B. Sullivan. J. Crit. Care, 57 (2020) 146—156
16. P. Vardevanyan, A. Antonyan, M. Parsadanyan, M. Torosyan, A. Karapetian. J. Biomol. Struct. Dyn., 34, N 7 (2016) 1377—1382
17. M. A. Parsadanyan, M. A. Shahinyan, A. P. Antonyan. Proc. YSU, Chem. Biol., 54, N 2 (2020) 112—117
18. R. Rohs, H. Sklenar. J. Biomol. Struct. Dyn., 21, N 5 (2004) 699—711
19. P. O. Vardevanyan, A. P. Antonyan, M. A. Parsadanyan, M. A. Shahinyan, V. G. Sahakyan. J. Biomol. Struct. Dyn., 36, N 14 (2018) 3607—3613
20. В. Зенгер. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот, Москва, Мир (1987)
Рецензия
Для цитирования:
Мовсесян З.О., Антонян А.П., Вардеванян П.О. Механизм связывания метиленового синего с одноцепочечными синтетическими полинуклеотидами poly(rA) и poly(rU). Журнал прикладной спектроскопии. 2023;90(4):547-552.
For citation:
Movsesyan Z.O., Antonyan A.P., Vardevanyan P.O. Mechanism of Binding of Methylene Blue with Single-Stranded Synthetic Polynucleotides Poly(rA) and Poly(rU). Zhurnal Prikladnoii Spektroskopii. 2023;90(4):547-552. (In Russ.)