

Применение линейного поиска для расчета канонического тензорного разложения спектров молекулярной флуоресценции
https://doi.org/10.47612/0514-7506-2023-90-1-90-96
Аннотация
Выделение групп флуорофоров в растворенном органическом веществе с помощью канонического тензорного разложения PARAFAC трехмерных спектров флуоресценции возбуждение/испускание широко используется при изучении природных вод, однако его расчет, особенно на стадии валидации, требует очень больших временных затрат. Рассмотрены несколько стратегий ускорения канонического тензорного разложения для спектров молекулярной флуоресценции морских вод. Показано, что стратегии с оптимизацией большого количества параметров экстраполяции не позволяют достичь значительного ускорения из-за больших временных затрат на эту операцию. Предложено решение, когда оптимизация шага проводится для одной переменной один раз на несколько итераций алгоритма. Подобный подход позволяет достичь ускорения расчетов с использованием линейного поиска. Максимальное ускорение в 2.3 раза достигнуто при использовании стратегии линейного поиска, в которой шаг экстраполяции является степенной функцией номера итерации, хотя в этом случае на некоторых стадиях работы алгоритма наблюдается коллинеарность последовательных шагов.
Ключевые слова
Об авторах
И. Н. КрыловРоссия
Москва
И. В. Селиверстова
Россия
Москва
Т. А. Лабутин
Россия
Москва
Список литературы
1. R. M. Cory, D. M. McKnight. Environ. Sci. Technol., 39, N 21 (2005) 8142—8149
2. C. A. Stedmon, S. Markager, R. Bro. Marine Chem., 82, N 3-4 (2003) 239—254
3. О. Е. Родионова, А. Л. Померанцев. Успехи химии, 75, № 4 (2006) 302—321
4. R. Bro. Chemometrics Intell. Lab. Systems, 38, N 2 (1997) 149—171
5. C. M. Andersen, R. Bro. J. Chemometrics, 17, N 4 (2003) 200—215
6. C. A. Stedmon, R. Bro. Limnology and Oceanography: Methods, 6, N 11 (2008) 572—579
7. C. J. Hillar, L.-H. Lim. J. ACM, 60, N 6 (2013) 45(1—39)
8. W. S. DeSarbo. An Application of PARAFAC to a Small Sample Problem, Demonstrating Preprocessing, Orthogonality Constraints, and Split-Half Diagnostic Techniques (Appendix), Rochester, New York, Social Science Research Network (1984)
9. I. N. Krylov, A. N. Drozdova, T. A. Labutin. Chemometrics Intell. Lab. Systems, 207 (2020) 104176
10. F. L. Hitchcock. J. Mathem. Phys., 6, N 1-4 (1927) 164—189
11. В. С. Муха. Изв. НАН Беларуси. Сер. физ.-мат. наук, 50, № 2 (2016) 71—81
12. В. С. Муха. Изв. НАН Беларуси. Сер. физ.-мат. наук, 50, № 4 (2016) 53—60
13. R. Bro. Multi-way Analysis in the Food Industry, The Netherlands, University of Amsterdam (1998)
14. C. Paulick, M. N. Wright, R. Verleger, K. Keller. Chemometrics Intell. Lab. Systems, 137 (2014) 97—109
15. P. Comon, X. Luciani, A. L. F. de Almeida. J. Chemometrics, 23, N 7-8 (2009) 393—405
16. R. A. Harshman. UCLA Working Papers in Phonetics, 16 (1970) 1—84
17. M. Rajih, P. Comon, R. A. Harshman. SIAM J. Matrix Analysis and Applications, 30, N 3 (2008) 1128—1147
18. N. E. Helwig. Multiway: Component Models for Multi-Way Data, https://CRAN.R-project.org/package=multiway (дата обращения 24.06.2022)
19. W. S. Cleveland, S. J. Devlin. J. Am. Statist. Ass., 83, N 403 (1988) 596—610
20. R. H. Byrd, P. Lu, J. Nocedal, C. Zhu. SIAM J. Sci. Comp., 16, N 5 (1995) 1190—1208
21. R. P. Brent. Algorithms for Minimization without Derivatives, Mineola, New York, Dover Publications (2002)
22. C. A. Andersson, R. Bro. Chemometrics Intell. Lab. Systems, 52, N 1 (2000) 1—4
23. K. R. Murphy, C. A. Stedmon, D. Graeber, R. Bro. Anal. Methods, 5, N 23 (2013) 6557
24. A. Zsolnay, E. Baigar, M. Jimenez, B. Steinweg, F. Saccomandi. Chemosphere, 38, N 1 (1999) 45—50
25. A. N. Drozdova, I. N. Krylov, A. A. Nedospasov, E. G. Arashkevich, T. A. Labutin. Front. Marine Sci., 9 (2022)
Рецензия
Для цитирования:
Крылов И.Н., Селиверстова И.В., Лабутин Т.А. Применение линейного поиска для расчета канонического тензорного разложения спектров молекулярной флуоресценции. Журнал прикладной спектроскопии. 2023;90(1):90-96. https://doi.org/10.47612/0514-7506-2023-90-1-90-96
For citation:
Krylov I.N., Seliverstova I.V., Labutin T.A. Implementation of Line Search for PARAFAC Analysis of Fluorescence Excitation-Emission Matrix. Zhurnal Prikladnoii Spektroskopii. 2023;90(1):90-96. (In Russ.) https://doi.org/10.47612/0514-7506-2023-90-1-90-96